La jerarquía institucional es una cualidad de Blackboard que nos permite crear una estructura en nuestro entorno que copia la estructura de nuestra institución, y nos permite asignar recursos a las distintas unidades que la componen.

Utilizando la jerarquía, creamos nodos y subnodos que representan las distintas áreas, campuses, o departamentos, y asignamos a cada uno de ellos los cursos, usuarios y herramientas que les corresponden, así como administradores que pueden gestionar únicamente aquellos elementos que están asignados a su nodo administrado.

Los nodos pueden crearse manualmente, o via integración.